Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer2J3QPU5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms