Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5225J3QPL3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms