Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2035J3QP87 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2035J3QP87 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms