Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21972J3QN38 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21972J3QN38 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms