Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20918J3QN17 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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