Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Zfp616J3QN14 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Zfp616J3QN14 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Zfp616J3QN14 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Zfp616J3QN14 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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