Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms