Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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