Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms