Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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