Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms