Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pot1bH7BX60 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pot1bH7BX60 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms