Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pabpc4lG5E8X2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms