Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn20G5E8X0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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