Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcf11G3X9Z4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms