Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms