Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SprtnG3X912 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SprtnG3X912 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms