Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp72F8VQC1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp72F8VQC1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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