Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms