Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Herc6F2Z461 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Herc6F2Z461 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc6F2Z461 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Herc6F2Z461 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Herc6F2Z461 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Herc6F2Z461 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Herc6F2Z461 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc6F2Z461 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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