Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Taf4E9QAP7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Taf4E9QAP7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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