Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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