Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtproE9Q612 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms