Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20518E9Q548 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms