Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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