Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pdzd2E9Q1M1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pdzd2E9Q1M1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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