Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt78E9Q0F0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms