Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc1E9Q043 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms