Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gcom1E9PZ54 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms