Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms