Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc8E9PWG2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms