Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30bE9PVL6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms