Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc62E9PVD1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc62E9PVD1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms