Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FgaE9PV24 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FgaE9PV24 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgaE9PV24 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
FgaE9PV24 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FgaE9PV24 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms