Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC035044E0CXF8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms