Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms