Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms