Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm4871D3Z0W7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4871D3Z0W7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms