Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc8D3YZV8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms