Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc6D3YZP9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms