Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc170D3YXL0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms