Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SafbD3YXK2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SafbD3YXK2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms