Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrc5C3VPR6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc5C3VPR6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms