Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smok3bC0HKC9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms