Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nxpe3B9EKK6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms