Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cttnbp2B9EJA2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms