Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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