Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms