Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah3B2RWG3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Siah3B2RWG3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms