Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rd3lB2RV38 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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